Om prosjektet
Den viktigste forbedringen som kreves innen dyreavl og -forvaltning for å møte utfordringene knyttet til fremtidig matproduksjon, er evnen til å bruke dyrets genetiske kode (genotype «G») mer nøyaktig for å forutsi dets egenskaper (fenotype «P»). G2P-forskning (G2P = genotype til phenotype) er svært kraftfull og gjør det for eksempel mulig å forutsi hvor motstandsdyktige visse dyr vil være mot ulike sykdommer.
Denne informasjonen kan deretter brukes til å ta effektive og bærekraftige avlsbeslutninger og til å tilpasse dyreholdspraksis. G2P-forskning byr imidlertid på betydelige utfordringer. På «G»-siden forbedrer FAANGs nåværende innsats gradvis genomannoteringen av land- og vannlevende oppdrettsdyrarter.
På «P»-siden arbeider eksisterende forsknings- og fenotypingsinfrastrukturer for å få mer kunnskap om komplekse fenotypiske egenskaper (f.eks. hvordan metanutslipp kan reduseres hos oppdrettsdrøvtyggere) og deres genetiske arkitektur, og for å gi tilgang til in vivo-fenotypingsverktøy og -ressurser.
For å fylle gapene mellom «G»- og «P»-komponentene må vi kunne karakterisere svært komplekse egenskaper som sett av mellomliggende informative fenotyper langs hele kaskaden fra genom til celle, organisme, miljø, populasjon og på tvers av ulike miljøer. For å kunne møte utfordringene ved G2P på en adekvat måte, er det for tiden et gap i den europeiske forsknings- og innovasjonsinfrastrukturen når det gjelder å strømlinjeforme og forvalte de nødvendige dataene, ressursene og kapasitetene som forskere og interessenter i Europa trenger.
EuroFAANG-infrastrukturen «vil ta tak i denne forskningsutfordringen på europeisk og globalt nivå» og bidra til å øke europeisk fortreffelighet innen G2P-forskning.
Prosjektet er finansiert for tre år og representerer konseptutviklingsfasen i en infrastrukturs livssyklus.
Mål
Bygge videre på grunnlaget som er lagt av en rekke H2020-prosjekter med fokus på genomikk/epigenetikk/funksjonell annotering av husdyr, og effektiviser måten vi bruker og utvider kapasiteten innen G2P-forskning på husdyr for å oppnå sentrale prioriteringer på området.
Deltakere
NMBU deltakere
Eksterne deltakere
- Research Institute for Farm Animal Biology (FBN), Germany
- The Roslin Institute, University of Edinburgh, UK
- Wageningen University and Research Institute, Netherlands
- French National Research Institute for Agriculture, Food and Environment (INRAe), France
- European Molecular Biology Laboratory (EMBL)-European Bioinformatics Institute (EBI), UK European
- Forum for Farmed Animal Breeders (EFFAB), Belgium