Om dette emnet

Dette kurset gir en introduksjon til hvordan man designer og vurderer epidemiologiske studier. Studentene lærer å utvikle en studieprotokoll for enten en randomisert kontrollert studie eller en observasjonsstudie, og å kritisk vurdere studiedesign brukt i vitenskapelig forskning. Kurset dekker sentrale epidemiologiske mål, grunnleggende kausal tenkning, samt formulering av målsettinger og estimander. Studentene introduseres for vanlige observasjonsstudiedesign, randomiserte studier og evaluering av diagnostiske tester.

Viktige temaer omfatter identifisering av sentrale kilder til bias, forståelse av utvalgsstrategier, enkle beregninger av statistisk styrke og utvalgsstørrelse, samt vurdering av datakvalitet. Studentene lærer også å planlegge datainnsamling (inkludert spørreskjema), planlegge strukturering av datasett, og lage en skisse av et target trial og dets observasjonelle emulering. Retningsbestemt asykliske grafer brukes til å beskrive kausale antakelser og veilede valg av justeringsstrategier. Det kontrafaktiske rammeverket og antakelseser som må opfylles for å estimere kausale effekter blir introdusert.

Dette lærer du

De overordnede læringsmålene for dette kurset er å gjøre studentene i stand til å utvikle en solid protokoll for sin egen randomiserte kontrollerte kliniske studie eller observasjonsstudie, samt å kunne vurdere studiedesign i vitenskapelige publikasjoner kritisk . Dette innebærer å lære å:

  • Estimere og tolke mål på sykdomsforekomst og mål på assosiasjon.
  • Beskrive og anvende tilnærminger til å studere kausalitet, inkludert det kontrafaktiske rammeverket.
  • Formulere tydelige og veldefinerte formål for epidemiologiske studier.
  • Spesifisere estimander og mål-estimater som svarer på studiens formål.
  • Beskrive hva som karakterisierer randomiserte kontrollerte kliniske studier, evalueringer av målinger og diagnostiske tester, samt observasjonsstudier, inkludert prevalensstudier, kohortstudier, case‑kohort- og case‑kontroll‑studier, tverrsnittsdesign, avbrutt tidsserie‑design og selvkontrollerte kausus‑serier.
  • Diskutere styrker og svakheter ved ulike studiedesign og begrunne valg av design for egen studie.
  • Identifisere kilder til bias (seleksjon, informasjon, konfundering, immortal time‑bias) i både planlagte studier og publiserte artikler.
  • Diskutere hvordan ulike utvalgsstrategier påvirker seleksjonsbias og generaliserbarhet, og utforme en hensiktsmessig utvalgsplan for egen studie.
  • Gjøre enkle beregninger av statistisk styrke og utvalgsstørrelse, og diskutere når mer avanserte tilnærminger kan være nødvendige.
  • Foreslå metoder for å evaluere datakvalitet, inkludert kvaliteten på registerdata og andre sekundærdata, og diskutere hvordan datakvalitet påvirker informasjonsbias.
  • Planlegge godt strukturerte, analyseklare datasett.
  • Planlegge en spørreskjemabasert datainnsamling, inkludert utvikling av spørreskjema.
  • Spesifisere en target trial (inklusjonskriterier, tid null, behandlingsstrategier, utfall, oppfølging, kausalt estimand), og designe en observasjonsbasert emulering som samsvarer med dette.
  • Bruke retningsbestemte asykliske grafer til å uttrykke kausale antakelser, vurdere identifiserbarhet av kausale estimander og avgjøre hvilke data og justeringssett som kreves.
  • Vurdere om antakelsense/forutsetningen for kausal effekt estimering (utbytbarhet, positivitet, konsistens-antakelsen, ingen umålt konfundering, ingen interferans) sannsynligvis vil bli oppfylt i en planlagt studie.
  • Læringsaktiviteter

    Alle temaer introduseres gjennom forelesninger og øvelser, og studentene skal i tillegg studere dem på egen hånd (for eksempel ved å lese artikler og kapitler i lærebøker). Studentene skal arbeide grundig med å utarbeide en studieprotokoll for sin egen epidemiologiske studie, og undervisere gir veiledning gjennom denne prosessen.
  • Pensum

    Anbefalt litteratur

    Kapitler i lærebøker:

    Chapters: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 in Dohoo, Ian Robert, Wayne Martin, and Henrik Stryhn. 2014. Veterinary Epidemiologic Research. 2nd ed. VER Inc. Upei.ca/ver.

    Chapters: 1, 2, 3, 6, 7, 8 in Hernan, Miguel A., and James M Robins. Causal Inference: What If. 1st ed. Chapman & Hall/CRC. https://www.hsph.harvard.edu/miguelhernan/causal-inference-book/.

    Fagfelle-vurderte vitenskapelige artikler:

    Birkegård, Anna Camilla, Mette Ely Fertner, Vibeke Frøkjaer Jensen, et al. 2018. "Building the Foundation for Veterinary Register-Based Epidemiology: A Systematic Approach to Data Quality Assessment and Validation." Zoonoses and Public Health 65 (8): 936-46. https://doi.org/10.1111/zph.12513.

    Eriksen, Esben Oestergaard, Simon Smed, Karl Johan Klit, and John Elmerdahl Olsen. 2019. "Factors Influencing Danish Veterinarians’ Choice of Antimicrobials Prescribed for Intestinal Diseases in Weaner Pigs." Veterinary Record 184 (26): 798-798. https://doi.org/10.1136/vr.105004.

    Hernán, Miguel A., and James M. Robins. 2016. "Using Big Data to Emulate a Target Trial When a Randomized Trial Is Not Available: Table 1." American Journal of Epidemiology 183 (8): 758-64. https://doi.org/10.1093/aje/kwv254.

    O’Connor, A.M., J.M. Sargeant, I.R. Dohoo, et al. 2016. "Explanation and Elaboration Document for the STROBE-Vet Statement: Strengthening the Reporting of Observational Studies in Epidemiology-Veterinary Extension." Journal of Veterinary Internal Medicine 30 (6): 1896-928. https://doi.org/10.1111/jvim.14592.

    Pegram, Camilla, Karla Diaz-Ordaz, Dave C. Brodbelt, et al. 2024. "Target Trial Emulation: Does Surgical versus Non-Surgical Management of Cranial Cruciate Ligament Rupture in Dogs Cause Different Outcomes?" Preventive Veterinary Medicine 226 (May): 106165. https://doi.org/10.1016/j.prevetmed.2024.106165.

    Rothman, Kenneth J., and Sander Greenland. 2005. "Causation and Causal Inference in Epidemiology." American Journal of Public Health 95 (S1): S144-50. https://doi.org/10.2105/AJPH.2004.059204.

    Sargeant, Jan M., Annette M. O’Connor, David G. Renter, and Audrey Ruple. 2024. "What Question Are We Trying to Answer? Embracing Causal Inference." Frontiers in Veterinary Science 11 (May): 1402981. https://doi.org/10.3389/fvets.2024.1402981.

    Sargeant, Jan M., Annette M. O’Connor, Sarah C. Totton, and Ellen R. Vriezen. 2022. "Watch Your Language: An Exploration of the Use of Causal Wording in Veterinary Observational Research." Frontiers in Veterinary Science 9. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fvets.2022.1004801.

    Shmueli, Galit. 2010. "To Explain or to Predict?" Statistical Science 25 (3). https://doi.org/10.1214/10-STS330.

    Wickham, Hadley. 2014. "Tidy Data." Journal of Statistical Software 59 (September): 1-23. https://doi.org/10.18637/jss.v059.i10.

    Foreslått

    Stone, D. H. 1993. "Design a Questionnaire." Bmj 307 (6914): 1264-66.

  • Vurderingsordning, hjelpemiddel og eksamen

    Skriftlig eksamen. Studenten skal levere en protokoll for sin egen epidemiologiske studie, i tråd med malen som utleveres i løpet av kurset. Studenter som ikke skal gjennomføre en epidemiologisk studie kan levere en fiktiv protokoll. Det er ingen begrensninger på tillatte hjelpemidler. Studentene oppfordres til å samarbeide med veiledere og andre kolleger som deltar i studien, og alle bidrag til protokollen skal erklæres i den innleverte versjonen. Vurdering: bestått/ikke bestått.

    Oppgave Karakterregel: Bestått/ Ikke bestått
  • Om bruk av KI

  • Obligatorisk aktivitet

    Tre innleveringer med utkast til deler av studentens protokoll for eget studie må leveres. Studenten skal også gi kritisk fagfellevurdering av en annen students innleveringer.
  • Merknader

    Påmeldingsfrist er 1. februar.

    For administrative henvendelser: phd.radgiver.vet@nmbu.no

  • Opptakskrav

    Åpent for PhD kandidater fra NMBU og andre universiteter. Åpent for veterinære forskerlinjestudenter ved NMBU.