NOVA-412 Automatisert feltfenotyping

Vi står overfor klimaendringer som krever en raskere utvikling av nye plantesorter og effektive teknologier som kan brukes i framtidas landbruk. Dette kurset har som mål å gi en introduksjon til de nye framvoksende forskningsområdene innen plantefenotyping med fokus på fenotyping av planter i feltforsøk og dataanalysemetoder relatert til dette.

Kurset vil introdusere de framvoksende teknologiene relatert til i) kontrollerte miljø som gjør det mulig å simulere og teste framtidige klimaforhold, ii) automatiserte og bildebaserte fenotypings­teknologier som gjør det lettere å koble genotyper til fenotyper, iii) «high throughput» feltfenotyping, iv) bioinformatikk og analyser av -omics data for å forstå molekylære nettverk. Kurset vil ha et spesielt fokus på fenotyping av planter i feltforsøk, og vil gi studentene praktisk erfaring med bruk av håndholdte sensorer, automatisk bildetaking med drone og robot og etterfølgende dataanalyser for å besvare biologiske spørsmål. Formålet med kurset er å gi studentene basiskunnskap og innsikt i mulighetene som nye fenotypingsmetoder gir innen forskning på planter og som verktøy i foredling av nye plantesorter.

Deltakelse i forelesninger og skriving av læringsdagbok (2 ECTS)

• Kunnskap om hele spekteret av sensorer som er tilgjengelig for plantefenotyping
• Kunnskap om standard dataanalyseprosesser for fenotypingsdata fra feltforsøk, inkludert bildeanalyser
• Innsikt i mulighetene og utfordringene med ulike forsøksdesign i plantefenotyping

Deltakelse i workshops/øvinger (1 ECTS)

• praktisk erfaring i bruk av fenotypingsmetoder i feltforsøk, datainnsamling og datanalyser

Litteraturstudium, presentasjon, skriving av øvingsrapport som før- og etterarbeid (2 ECTS)

• innsikt i valgt biologisk prosess og/eller fenotypingsteknologi basert på studier av utvalgt litteratur
• bruk av tillært kunnskap gjennom skriving av øvingsrapport fra kurset