Vi står overfor klimaendringer som krever en raskere utvikling av nye plantesorter og effektive teknologier som kan brukes i framtidas landbruk. Dette kurset har som mål å gi en introduksjon til de nye framvoksende forskningsområdene innen plantefenotyping med fokus på fenotyping av planter i feltforsøk og dataanalysemetoder relatert til dette.

Kurset vil introdusere de framvoksende teknologiene relatert til i) kontrollerte miljø som gjør det mulig å simulere og teste framtidige klimaforhold, ii) automatiserte og bildebaserte fenotypings­teknologier som gjør det lettere å koble genotyper til fenotyper, iii) «high throughput» feltfenotyping, iv) bioinformatikk og analyser av -omics data for å forstå molekylære nettverk. Kurset vil ha et spesielt fokus på fenotyping av planter i feltforsøk, og vil gi studentene praktisk erfaring med bruk av håndholdte sensorer, automatisk bildetaking med drone og robot og etterfølgende dataanalyser for å besvare biologiske spørsmål. Formålet med kurset er å gi studentene basiskunnskap og innsikt i mulighetene som nye fenotypingsmetoder gir innen forskning på planter og som verktøy i foredling av nye plantesorter.

Deltakelse i forelesninger og skriving av læringsdagbok (2 ECTS)

• Kunnskap om hele spekteret av sensorer som er tilgjengelig for plantefenotyping
• Kunnskap om standard dataanalyseprosesser for fenotypingsdata fra feltforsøk, inkludert bildeanalyser
• Innsikt i mulighetene og utfordringene med ulike forsøksdesign i plantefenotyping

Deltakelse i workshops/øvinger (1 ECTS)

• praktisk erfaring i bruk av fenotypingsmetoder i feltforsøk, datainnsamling og datanalyser

Litteraturstudium, presentasjon, skriving av øvingsrapport som før- og etterarbeid (2 ECTS)

• innsikt i valgt biologisk prosess og/eller fenotypingsteknologi basert på studier av utvalgt litteratur
• bruk av tillært kunnskap gjennom skriving av øvingsrapport fra kurset

Forelesninger: Følgende tema vil bli behandlet:

• Metoder innen feltfenotyping
• Data prosessering og analyser av dronebilder fra feltforsøk
• Lavkostnads fenotypingsmetoder
• Klorofyll fluorescence teknologier i plantefenotyping
• Bioinformatiske analyser av -omics data

Praktisk arbeid med bruk av fenotypingsverktøy og tilhørende dataanalyser

Journal club: Studentpresentasjoner basert på tildelt litteratur, i grupper.

Litteratur som vil bli sendt til studentene før kurset

Forelesninger og øvinger under kursuken

Kurset er et felles nordisk NOVA PhD kurs organisert av Morten Lillemo, NMBU. Lærerer fra NMBU, Universitetet i Helsinki og Sveriges Lantbruksuniversitet (SLU) vil undervise på kurset. Oppdaterte kursbeskrivelser og informasjon om påmelding vil komme på NOVAs nettsider:

https://www.slu.se/nova

25 timer seminar, workshops og øvinger

15 timer forelesninger

85 timer individuelt arbeid

Totalt: 125 timer

Kurset er ment for ph.d. studenter med grunnleggende kunnskaper i relevante fagområder som planteforedling, biologi og miljøvitenskap. Studenter med forskning relatert til fenotyping i deres ph.d. prosjekt vil bli prioritert. 

Studenter på ph.d. nivå har førsteprioritet. Masterstudenter kan tas opp hvis det er ledig plass.

25 timer seminar, workshops og øvinger

15 timer forelesninger