NOVA-412 Automatisert feltfenotyping
English course information
Søk etter andre emner
Velg annet år
Viser emneinfo for studieåret 2022 - 2023.
Emneansvarlige: Morten Lillemo
Studiepoeng: 5
Ansvarlig fakultet: Fakultet for biovitenskap
Frekvens: Årlig, rotasjon mellom nordiske land
Undervises på språk: EN
(NO=norsk, EN=Engelsk)
(NO=norsk, EN=Engelsk)
Begrensning antall plasser:
25
Undervises i periode:
Emnet går i juli 2022 som et NOVA-kurs. Det vil være en ukessamling på NMBU, Ås, 4.-8. juli, 2022.
Første gang: Studieår 2019-2020
Fortrinnsrett: <p>Kurset er ment for ph.d. studenter med grunnleggende kunnskaper i relevante fagområder som planteforedling, biologi og miljøvitenskap. Studenter med forskning relatert til fenotyping i deres ph.d. prosjekt vil bli prioritert. </p><p>Studenter på ph.d. nivå har førsteprioritet. Masterstudenter kan tas opp hvis det er ledig plass.</p>
Undervises hvor?: Campus Ås
Emnets innhold:
Vi står overfor klimaendringer som krever en raskere utvikling av nye plantesorter og effektive teknologier som kan brukes i framtidas landbruk. Dette kurset har som mål å gi en introduksjon til de nye framvoksende forskningsområdene innen plantefenotyping med fokus på fenotyping av planter i feltforsøk og dataanalysemetoder relatert til dette.
Kurset vil introdusere de framvoksende teknologiene relatert til i) kontrollerte miljø som gjør det mulig å simulere og teste framtidige klimaforhold, ii) automatiserte og bildebaserte fenotypingsteknologier som gjør det lettere å koble genotyper til fenotyper, iii) «high throughput» feltfenotyping, iv) bioinformatikk og analyser av -omics data for å forstå molekylære nettverk. Kurset vil ha et spesielt fokus på fenotyping av planter i feltforsøk, og vil gi studentene praktisk erfaring med bruk av håndholdte sensorer, automatisk bildetaking med drone og robot og etterfølgende dataanalyser for å besvare biologiske spørsmål. Formålet med kurset er å gi studentene basiskunnskap og innsikt i mulighetene som nye fenotypingsmetoder gir innen forskning på planter og som verktøy i foredling av nye plantesorter.
Læringsutbytte:
Deltakelse i forelesninger og skriving av læringsdagbok (2 ECTS)
- Kunnskap om hele spekteret av sensorer som er tilgjengelig for plantefenotyping
- Kunnskap om standard dataanalyseprosesser for fenotypingsdata fra feltforsøk, inkludert bildeanalyser
- Innsikt i mulighetene og utfordringene med ulike forsøksdesign i plantefenotyping
Deltakelse i workshops/øvinger (1 ECTS)
- praktisk erfaring i bruk av fenotypingsmetoder i feltforsøk, datainnsamling og datanalyser
Litteraturstudium, presentasjon, skriving av øvingsrapport som før- og etterarbeid (2 ECTS)
- innsikt i valgt biologisk prosess og/eller fenotypingsteknologi basert på studier av utvalgt litteratur
- bruk av tillært kunnskap gjennom skriving av øvingsrapport fra kurset
Læringsaktiviteter:
Forelesninger: Følgende tema vil bli behandlet:
- Metoder innen feltfenotyping
- Data prosessering og analyser av dronebilder fra feltforsøk
- Lavkostnads fenotypingsmetoder
- Klorofyll fluorescence teknologier i plantefenotyping
- Bioinformatiske analyser av -omics data
Praktisk arbeid med bruk av fenotypingsverktøy og tilhørende dataanalyser
Journal club: Studentpresentasjoner basert på tildelt litteratur, i grupper.
Læringsstøtte:
Lærerne vil være tilstede under kursuken og gi aktiv veiledning av læringsaktivitetene
Pensum:
Litteratur som vil bli sendt til studentene før kurset
Forelesninger og øvinger under kursuken
Forutsatte forkunnskaper:
Mastergrad i relevant fagområde. Relevante områder: jordbruk, biologi og miljøvitenskap.
Obligatorisk aktivitet:
Selvstudium og forberedelse av presentasjon, aktiv deltakelse i journal club, forelesninger og øvinger, skriving av læringsdagbok og øvingsrapport.
Vurderingsordning:
Bestått/ikke bestått basert på aktiv deltakelse i øvingene på kurset, presentasjon av litteraturseminar, innlevering av læringsdagbok og øvingsrapport
Sensor:
Merknader:
Kurset er et felles nordisk NOVA PhD kurs organisert av Morten Lillemo, NMBU. Lærerer fra NMBU, Universitetet i Helsinki og Sveriges Lantbruksuniversitet (SLU) vil undervise på kurset. Oppdaterte kursbeskrivelser og informasjon om påmelding vil komme på NOVAs nettsider:
https://www.slu.se/nova
Normert arbeidsmengde:
25 timer seminar, workshops og øvinger
15 timer forelesninger
85 timer individuelt arbeid
Totalt: 125 timer
Opptakskrav:
Kurset er ment for ph.d. studenter med grunnleggende kunnskaper i relevante fagområder som planteforedling, biologi og miljøvitenskap. Studenter med forskning relatert til fenotyping i deres ph.d. prosjekt vil bli prioritert.
Studenter på ph.d. nivå har førsteprioritet. Masterstudenter kan tas opp hvis det er ledig plass.
Overlapp:
Ingen
Undervisningstid:
25 timer seminar, workshops og øvinger
15 timer forelesninger
Eksamensdetaljer: Mappevurdering: Bestått/ Ikke bestått