BIO332 Eksperimentell molekylær mikrobiologi
English course Information
Søk etter andre emner
Viser emnet slik det undervises i studieåret med start i 2019 .
Emneansvarlige: Morten Kjos
Medvirkende: Daniel Straume, Inga Leena Angell, Pawel Michal Lycus, Ine Storaker Myrbråten, Linda Liberg Bergaust, Else Marie Aasen, Leiv Sigve Håvarstein, Zhian Salehian, Rannei Tjåland, Knut Rudi
Studiepoeng: 10
Ansvarlig fakultet: Fakultet for kjemi, bioteknologi og matvitenskap
Frekvens: Årlig
Undervises på språk: EN, NO
(NO=norsk, EN=Engelsk)
(NO=norsk, EN=Engelsk)
Begrensning antall plasser:
24
Undervises i periode:
Emnet starter i januarblokka. Emnet har undervisning/vurdering i januarblokka + undervisning/vurdering i vårparallellen.
Første gang: Studieår 2009-2010
Fortrinnsrett: <p>Kurset er obligatorisk for studenter på studieprogrammene</p><list listType="bulleted"><listItem>Master i Bioteknologi, retning Mikrobiologi</listItem><listItem>Master i teknologi (siv.ing.), studieretning kjemi og bioteknologi, spesialisering molekylærbiologi</listItem></list><p></p>
Emnets innhold:
Emnet er et intensivt 3-ukers laboratoriekurs i januar (uke 1-3). Noen forelesninger/seminarer vil bli gitt i denne delen, mens resten gis i første del av vårparallellen. Totalt vil det bli gitt 18 forelesninger. I disse vil det bli lagt vekt på utvalgte, tidsaktuelle temaer, og å diskutere oppnådde resultater fra laboratorieøvelsene i relasjon til den vitenskapelige litteraturen. Laboratorieøvelsene omfatter metoder som brukes til:
- måling av genekspresjon og biologisk mangfold i ulike økosystemer
- karakterisering og identifisering av bakterier
- horisontal genoverføring
- genetisk regulering
- metagenomsekvensering
- resultattolking og diskusjoner omkring de ulike metodene
Studentene skriver en fyldig rapport fra laboratorieøvelsene.
Læringsutbytte:
Kurset er tett knyttet til aktuelle forskningstemaer innenfor mikrobiologi og formidler «state-of-the-art»-kunnskap om tre viktige temaer: Genetisk regulering av anaerob respirasjon med konsekvenser for klimagassutslipp; horisontal genoverføring og dens betydning for spredning av antibiotika-resistens; og sammenhenger mellom tarmflora-sammensetning og helse. Forståelse av prinsippene bak flere av de vanligst brukte teknikkene innen moderne mikrobiologi.
Kurset gir god trening i mange av de vanligste teknikkene som brukes innen moderne mikrobiologi, med hovedvekt på molekylære metoder. Studentene lærer hvordan de ulike metodene kan brukes, og deres styrker/svakheter. Laboratorieøvelsene er lagt opp som forskningsprosjekter som sammenfattes i en individuell, skriftlig rapport. Dette gir ferdigheter i utførende og planlegging av eksperimenter; data-analyse og - fremstilling; og trening i innsamling av relevant litteratur for å sette inn resultatene i en bredere sammenheng. Regelmessige seminarer blir holdt hvor studentene får øvelse i å sammenfatte og diskutere utvalgte vitenskapelige artikler.
Kurset gir studentene god praktisk og teoretisk forberedelse for gjennomføring av masteroppgave og er også nyttig for studenter i tidlig fase av PhD-utdanningen. Kurset innebærer både samarbeide i gruppe og individuell øvelse i skriving og data-analyse, og gir trening i skriftlig og muntlig fremstilling, i løsning av komplekse problemer, og i kritisk lesing og tolking av vitenskapelige tekster.
Læringsaktiviteter:
Laboratorieøvelser. Seminarer.
Seminarene innebærer presentasjon av artikler og metoder, hvor også studentene deltar aktivt. Hovedfokuset i kurset er å gi studentene innsikt i noen utvalgte metoder som er aktuelle i dagens mikrobiologiske forskning. Spesialforelesninger gis i tilknytning til laboratorieøvelsene, eller som separate forelesninger/seminarer.
Læringsstøtte:
Lærerne er tilstede under hele kursperioden, og kan dessuten nås via e-post. Canvas.
Pensum:
Forelesninger og utvalgte, vitenskapelige artikler, som vil fungere som et grunnlag for skriving av laboratorierapporten og for muntlig eksamen.
Forutsatte forkunnskaper:
- Biokjemi tilsvarende KJB200
- Generell mikrobiologi tilsvarende BIO230
- Molekylærbiologi tilsvarende BIO210
Anbefalte forkunnskaper:
Labkursene BIO233 og BIO211, eller tilsvarende.
Obligatorisk aktivitet:
Forelesninger, seminarer og laboratorieøvelser.
Vurderingsordning:
Skriftlig rapport av eksperimentell forskningsoppgave, teller 50% av karakteren. Muntlig eksamen hvor studenten blir spurt om innholdet fra labkurset og pensum som består av utvalgte vitenskapelige artikler innen relaterte temaer. Teller 50% av karakteren. Ekstern sensor både av skriftlig oppgave og eksamen.
Sensor:
Ekstern sensur av skriftlige oppgave.
Ekstern sensor på muntlig eksamen.
Merknader:
Hvis mange studenter vil skriftlig eksamen vurderes.
Normert arbeidsmengde:
Laboratoriearbeid: 120 timer. Seminarer/forelesninger: 18 timer. Resulatbearbeiding, selvstudier og skriving av fyldig rapport fra laboratorieøvelsene: 162 timer.
Opptakskrav:
Realfag
Undervisningstid:
Januarblokk: 3 ukers (120 timer) laboratoriekurs, med enkelte forelesninger.
Vårparallell: 2 dobbettimer med seminarer/forelesninger per uke i første halvdel av vårparallellen, annonseres på Canvas.
Innlevering av skriftlig rapport: uke 9. Muntlig eksamen er normalt i uke 13, 14 eller 15, avhengig av når påsken er.
Hjelpemidler ved skriftlig eksamen(er): A1 Ingen kalkulator. Ingen andre hjelpem.
Eksamensdetaljer: Langsgående vurdering: A - E / Ikke bestått