BIO327 Fra gen til funksjon

Studiepoeng:10

Ansvarlig fakultet:Fakultet for biovitenskap

Emneansvarlig:Rómulo Sacramento Sobral

Campus / nettbasert:Undervises campus Ås

Undervisningens språk:Engelsk

Antall plasser:Maks 20 studenter

Frekvens:Årlig

Forventet arbeidsmengde:250 timer

Undervisnings- og vurderingsperiode:Høstparallell

Om dette emnet

Vil du lære hvordan egenskaper kontrolleres av genaktivitet? Liker du molekylærbiologi og ønsker å bli dyktig i laboratorieteknikker? I så fall er BIO327 det rette kurset for deg. Forskning er for tiden i en situasjon der mange kandidatgener for ulike egenskaper har blitt identifisert, og evnen til å forstå og beskrive deres funksjonelle rolle forbedres eksponentielt. BIO327 bygger videre på dette ved å gi studentene en oversikt over teorien samt de bioinformatiske og laboratorieteknikkene som er nødvendige for å integrere molekylær kunnskap og avdekke genfunksjon. Vi vil bruke planter som de grunnleggende modellene for forklaringene, men mesteparten av informasjonen kan også brukes på alle andre eukaryoter. Kurset vil bli delt inn i ukentlige forelesninger og praktiske økter som vil inkludere gjennomføring av minst syv laboratorieprosedyrer. I hver labøkt vil studentene jobbe individuelt og samle data for å skrive en enkelt labrapport som vil omfatte alle 7 øktene som vil bli levert ved slutten av året. Labøktene vil inkludere fenotypanalyse, kloning, uttrykksanalyse, proteinanalyse, genrapporteringsaktivitet og transformasjon.

Dette lærer du

Kunnskap

Studentene vil bli kjent med hovedtypene av genetiske reguleringsmekanismer fra epigenetisk opp til post-translasjonell regulering.
Studentene vil bli kjent med nøkkelregulatorer involvert i genfunksjon og fremheve de forskjellige reguleringsnivåene disse regulatorene er utsatt for (kromatinstruktur, miRNA og transkripsjonsfaktorer)
Studentene vil forstå begrunnelsen bak ulike laboratorieteknikker og bioinformatiske analyser som kan brukes til å beskrive genfunksjon, for eksempel komparativ genomikk, forover- og bakovergenetikk, mutantanalyse (knock out, knock in) og genotyping, immunmerking, protein-protein og protein-DNA-interaksjoner, ekspresjonsanalyse (qRT-PCR eller genreporteranalyser) eller forbigående og permanent transformasjon.

Ferdigheter

Studentene skal ha praktisk erfaring med ulike teknikker innen molekylærbiologi og deres betydning i biologisk forskning
Studentene skal kunne utforme en strategi for å avdekke genfunksjonen til en for et bestemt personlighetstrekk
Studentene vil være i stand til å integrere data hentet fra forskjellige kilder for å trekke slutninger om genfunksjon, for eksempel eksperimenter på molekylært, celle-, vevs- eller hele individnivå, kvantitative/populasjonsgenetiske analyser og ulike typer -omics.

Læringsaktiviteter
Forelesninger (15 timer). 5 øvelser (1 bioinformatikk og 6 lab-øvelser, på 3 timer hver)
Læringsstøtte
Canvas
Pensum
Pensum vil bli gjort tilgjengelig i Canvas i løpet av semesteret, som f.eks bokkapitler og vitenskapelige artikler.
Forutsatte forkunnskaper
BOT200
Anbefalte forkunnskaper
Forståelse av DNA struktur og DNA regulering er anbefalt. I tillegg bør studenten ha en forståelse for hypotese testing.
Vurderingsordning, hjelpemiddel og eksamen
Samlet vurdering.
Skriftlig 3-timers eksamen i eksamensperioden som teller av 45% karakteren.
Lab rapporter som teller 45% av karakteren
Aktiv deltagelse i forlesninger (10%)
Sensorordning
Sensor vil godkjenne eksamensspørsmål og vurderingsopplegg
Obligatorisk aktivitet
Labøvelser er obligatoriske
Merknader
Ved færre enn 6 oppmeldte studenter vil et forenklet undervisningsopplegg bli vurdert.
Undervisningstider
15 hours of lectures
24 hours lab time
20 hours of practical exercises
3 hour exam
Opptakskrav
Realfagskrav