BIO327 Fra gen til funksjon

Vil du lære hvordan egenskaper kontrolleres av genaktivitet? Liker du molekylærbiologi og ønsker mer erfaring med laboratoriearbeid? Da er BIO327 det rette kurset for deg!

Forskningen er i dag i en situasjon der mange kandidatgener for ulike egenskaper er identifisert, og evnen til å forstå og beskrive deres funksjonelle roller øker raskt. BIO327 bygger videre på dette ved å gi studentene en oversikt over teorien samt de bioinformatiske metodene og laboratorieteknikkene som er nødvendige for å integrere molekylær kunnskap og avdekke genfunksjon.

Vi bruker planter som modellsystemer i undervisningen, men mesteparten av teorien og metodene kan også brukes på andre eukaryote organismer.

Kurset er delt inn i ukentlige forelesninger og totalt syv labøvelser. I hver labøvelse vil studentene jobbe individuelt og samle data til en samlet labrapport som dekker alle syv, og som leveres ved slutten av kurset. Labøvelsene vil inkludere kloning, transformering, reportergenanalyse, ekspresjonsanalyse, proteinanalyse og fenotypeanalyse.

Kunnskap

• Studentene vil bli kjent med hovedtypene av genetiske reguleringsmekanismer, fra epigenetisk regulering til posttranslasjonell regulering.

• Studentene vil bli kjent med nøkkelregulatorer involvert i genfunksjon, og forstå de ulike reguleringsnivåene disse regulatorene påvirkes av (kromatinstruktur, miRNA og transkripsjonsfaktorer).

• Studentene vil forstå teorien bak og hvorfor man bruker de ulike laboratorieteknikkene og bioinformatiske analysene til å beskrive genfunksjon, for eksempel komparativ genomikk, forover- og revers genetikk, mutantanalyse (knockout- og knockin-strategier), genotyping, immunmerking, protein-protein- og protein-DNA-interaksjoner, ekspresjonsanalyse (qRT-PCR eller reportergenanalyser) samt forbigående og stabil transformasjon.

Ferdigheter

• Studentene skal ha praktisk erfaring med ulike teknikker innen molekylærbiologi og deres betydning i biologisk forskning.

• Studentene skal kunne utforme en strategi for å avdekke genfunksjonen til et bestemt fenotypisk trekk.

• Studentene vil være i stand til å sammenstille data hentet fra forskjellige kilder for å trekke slutninger om genfunksjon, for eksempel eksperimenter på molekylært, celle-, vevs- eller helorganismenivå, kvantitative/populasjonsgenetiske analyser og ulike typer -omikkdata.