• Generell optikk: elektromagnetisk stråling, oppløsningsevne, forstørrelse, brytningsindeks, diffraksjon, faseforskyvning, interferens.
• Spesiell optikk: generell oppbygning av mikroskopene og strålegangen i LM (lysmikroskopi), CLSM (konfokal laser skanning mikroskopi), SEM (skanning elektron mikroskopi) og TEM (transmisjon elektron mikroskopi).
• Gjennomgang av ulike optiske teknikker og kontrasteringsmetoder i LM, CLSM, SEM og TEM.
• Generelle prepareringsteknikker til LM, CLSM, SEM og TEM.
• Forelesninger, demonstrasjoner og praktiske øvelser gir grundig opplæring i bruk av mikroskopene og deres ulike avbildningsteknikker. 

Studentene skal tilegne seg teoretiske og praktiske kunnskaper mht. optikk, prøvebehandling og bildedannelse slik at de kan:

1) forklare sentrale optiske begrep

2) beskrive strålegang og bildedannelse i ulike mikroskoptyper

3) foreta rasjonelle valg mht. prøvebehandling og avbildningsmetoder ut fra prøvetype og problemstilling

4) vurdere og tolke ulike mikroskopbilder (egne og publiserte).

Studentene skal være i stand til å diagnostisere, innstille og bruke følgende mikroskop:

1) Lysmikroskop, med ulike typer optikk (lysfelt, mørkefelt, polarisasjon, fasekontrast, differensial interferens kontrast og fluorescence)

2) Konfokal laser skanning mikroskop

3) Skanning elektron mikroskop, i ulike avbildnings- modus (SEI og BEI) og røntgenanalyse.

4) Transmisjon elektron mikroskop.

Studentene skal også kunne bruke følgende utstyr innen prøvebehandling:

1) Ulike snitteteknikker: ultramikrotom, rotasjonsmikrostom, vibratom og cryostat

2) Kritisk punkt tørking og sputter coating for SEM

Studentene skal også kunne bruke et utvalg av metoder mht. prøvebehandling, farging/merking og enkel bildebehandling.