EMNET VIL IKKE GIS I 2023

Mikrobielle samfunn har stor innvirkning i naturen og i industrielle prosesser. De utgjør det største nivået av biologisk mangfold, noe som er nødvendig for deres funksjon og rolle. Vår forståelse av denne biologien er ny, og betinget av moderne sekvensering og tilhørende bioinformatiske metoder. Dette emnet introduserer, utforsker og vurderer ulike teknologier og bioinformatiske verktøy for slike studier. Vi vil fokusere på metoder for å studere strukturen (metagenomikk, genom-rekonstruksjon) og funksjonen (metatranskriptomikk, metaproteomikk) i slike samfunn.

• Evne til å designe eksperimenter og velge passende metoder og programvare
• Forklare populasjons-strukturen i et mikrobielt samfunn
• Utføre og vurdere assembly og taksonomisk gruppering og tolke resultatene
• Kombinere data fra ulike omikk-teknologier med tanke på funksjon hos det mikrobielle samfunnet
• Forklare og forstå hva som er begrensingene i metodene

Intensivkurs en uke samt en prosjekt-rapport som gjøres i etterkant. Hver ukedag i kursperioden består av:

• to en-timers forelesninger
• en fem-timers computer-lab under veiledning

Forelesninger 10 timer

Computer øvinger 25 timer

Selvstudium 90 timer

2 forelesninger per dag (1 time hver)

1 computer øving per dag (5 timer)