BIN303 Estimering av varianskomponenter - dyr og planter
Studiepoeng:5
Ansvarlig fakultet:Fakultet for biovitenskap
Emneansvarlig:Gunnar Klemetsdal
Campus / nettbasert:Undervises campus Ås
Undervisningens språk:Engelsk
Frekvens:BIN303 vil primært gis hvert annet år.
Forventet arbeidsmengde:125 timer, inkludert deltakelse i kollokvier og øvingsgrupper med 25 timer.
Undervisnings- og vurderingsperiode:Denne versjonen gis første gang i 2024, i vårparalellen.
Om dette emnet
Dette lærer du
Kunnskap
I emnet vil du få kunnskap om teori for å bestemme varianskomponenter basert på blanda lineære modeller og REML.
Ferdigheter
Du vil bli i stand til å regna ut REML-varianskomponenter ved hjelp av R, ved bruk av matriseralgebra og ved bruk av en ferdigskrudd R-pakke.
Generell kompetanse
Generelt vil emnet gi deg kompetanse i datahåndtering, programmering, lineær algebra, og estimeringsteori; og noe forståelse av avls- og foredlingsprogram.
- Annen hver uke forelesning med øvelser som programmeres i R, som gjennomgås i detalj påfølgende uke. Selvstudium av litteratur. Estimering av varianskomponenter på egne, realistisk store, datasett. Presentasjon for medstudenter og lærer.
- Lærer gjennomgår alle øvelser og deltar på alle kollokvium. Veiledning/hjelp vil bli gitt på semesteroppgaven og andre oppgaver.
- Kurset dekker kapittel 27 i Lynch and Walsh (1998), kapittel 15 i Mrode (2014), relevant dokumentasjon av R-pakke, samt forelesningsnotater og R-script.
- Fortrinnsvis BIN301, men i det minste god kunnskap i matrisealgebra og lineære modeller.
Noe husdyravl eller planteforedling på MSc-nivå, inkludert kunnskap om anetavle og genomisk slektskap.
God kunnskap om lineær algebra, vektor- og matrise-håndtering.
Dataprogrammering i R.
- Evaluering vil bli av semesteroppgaven, som viser resultat av beregning av varianskomponenter i reelle data med relevant R-pakke.
Semesteroppgave Karakterregel: Bestått/ Ikke bestått Hjelpemiddel: C3 Alle typer kalkulatorer, alle andre hjelpemidler - inkludert digitale - Evaluering av lærer og ekstern sensor.
Delta i kollokvier.
Presentere estimeringen av varianskomponenter i egne datasett, av størrelse relevant for avls- og foredlings-organisasjoner.
Kommentere/opponere til andres presentasjoner.
- Omtrent 12,5 timar kollokvium/forelesing og 12,5 timar øvinger.
- Realfag